Java Universal Network Graph

Estou envolvido em um projeto de pesquisa na área de representação do conhecimento, em particular, na representação do conhecimento em Física. Utilizei a IDE Protégé para gerar ontologias e preciso transpor esses resultados (basicamente arquivos RDF/OWL) de forma que os grafos correspondentes possam ser visualizados. A ferramenta que estou utilizando é o JUNG (Java Universal Network Graph), que é um projeto desenvolvido pelo SourceFourge. Há pouca documentação sobre o assunto, gostaria de ter acesso a outras ferramentas. Alguém sabe de alguma além dos tutoriais disponíveis no site?
Relacionei algumas ferramentas que encontrei em http://herlimenezes.wordpress.com/.