Javadoc

não estou encontrando o javadoc.exe para fazer a criação pelo eclipse!
utilizo a java 6.

O javadoc.exe só estará na sua máquina se você instalar o JDK, não só a JRE. Se você estiver usando o Eclipse, saiba que ele não exige o JDK completo para rodar, só a JRE; pode ser que seja por causa disso que você não esteja achando o JDK.

consegui!
Entretanto ocorre esse erro quando tento criar o javadoc!

C:\workspace\project\src\util\ConvertRTF.java:15: package org.apache.log4j does not exist
import org.apache.log4j.Logger;

esta ocorrendo em quase todos os imports!

Na hora de rodar o javadoc, é necessário especificar os mesmos JARs que são usados por uma compilação normal. O Javadoc precisa do compilador Java para funcionar, porque ele precisa fazer uma espécie de compilação para poder gerar a documentação.