JavaScript dentro do Java

Olá! Tenho uma dúvida, se é possível passar um código javascript para uma variável String no meu Bean?

Eu consegui execurtar o codigo javascript pelo meu Bean com RequestContext.getCurrentInstance().execute(“qualquer codigo javascript aqui”);
Más não é isso que eu quero, o que eu preciso é passar esse código pra uma variavel do tipo String e depois usar nos metodos da API que estou usando. Estou atualizando um sistema biometrico e ele usava applet, pega os valores javascript por getParameter(“funçãoJavaScript”) e armazenava em uma String Ex:
String digital = getParameter(“funçãoJavaScript”);

Minha ideia é deixar a aplicação sem o applet. Já consigo acionar o aparelho mas falta executar as funçoes javascript.