JFrame só aparece dentro do netbeans

Estou montando um programa em java, porém tem ocorrido uns probleminhas.
Na grande maioria das vezes que eu adiciono um JFrame ao clicar em rodar no netbeans ele roda perfeitamente, sendo chamado por um button ou um menu item, no entanto, quando compila o programa e executo ele, ao clicar no button ou no menu iten o novo JFrame não aparece.
Isso já ocorreu outras vezes com outros JFrames que adicionei, e fucei tanto para descobrir que da mesma forma que ocorreu, ele deixou de ocorrer.
Ou seja, está inconsistente, alguém já se deparou com algo parecido?
(OBS. mesmo adcionando um método main dentro dessa classe do JFrame novo e instanciando ela mesma, o problema continua, no entando dentro do ambiente netbeans ele roda perfeitamente…)