JPA - Atualizar dependências

Assuntos Gerais
#1

Olá. Estou tentando atualizar as dependências de uma @Entity mas não consigo.
Tentei de várias formas, inclusive this.getEntityManager().refresh(this.getEntityManager().merge(MINHA_ENTIDADE));
Não ocorre nenhuma exception mas também a dependência não sincroniza com o banco de dados.

Alguém sabe a maneira correta de fazer isso?
Grato.

#2

Correção: eu quis dizer referências, não dependências! Isso porque não são FKs, são campos simples =)

Grato.

#3

Problema na linha 3456.

#4