Jsmooth e Inno Setup Compiler

Bom dia pessoal, eu criei o .EXE do meu jar com o Jsmooth… ele funciona perfeitamente.
O problema é quando tento criar um instalador com o Inno Setup…
O instalador é criado, e após instalá-lo não funciona…

Seria algum problema com os caminhos dos arquivos?
Afinal, eu defino varios caminhos quando crio o exe, e não hora de fazer o instalador eu escolho uma outra pasta para ele ser instalado no computador do usuário…

Alguém já teve esse tipo de problema?

Agradeço…