Lê arquivo xml com problema de schema

Gostaria de saber se alguém sabe responder a esta questão:
Tenho uma aplicação que lê arquivos xml de uma pasta e a aplicação funciona em dois ambientes desenvolvimento e produção. No ambiente de desenvolvimento (windows 2000 profissional) os arquivos xml são abertos normalmente pela aplicação, já no ambiente em produção os arquivos apresentam erro de schema xml no momento em que a aplicação tenta abrí-los. Alguém tem alguma idéia do que pode estar acontecendo?
OBS: Não é problema de código e sim da maneira como os arquivos são vistos por ambientes diferentes. O que sugerem, para solução de problema?

Estes ambientes poderiam ser o IE e Mozila ??

Já enfrentei problemas de exibição devido a Tag’s estarem identadas
exemplo:

<minhaTag>
<tag>
</tag>
</minhaTag>

( O exemplo acima apenas funcionava no IE)

<minhaTag><tag>
</tag>
</minhaTag>

( O exemplo acima funcionava no IE e Mozila)
[/i]

Espero que ajude…

Pode ser problema de encoding, verifique.