Left Join no EJB 2.1

nobody ?

Não suporta (98% de certeza).
Mas se você precisar muito de algo assim e não tiver alternativa a não ser usar EJBQL (ouch!), eu tentaria obter uma referência para o entity bean que é o “parent” no relacionamento (algo como “select object(parent) from Parent_Entity parent where parent.pk = VALOR”) e ir navegando através de suas relações até obter o que eu gostaria. Mas, tenha cuidado: isso não pode não ser nem um pouco performático (aliás, não vai ser nada rápido, principalmente se forem objetos remotos).
Dica: Use um BMP+DAO. Caso seu arquiteto não deixa, cubra-o de porrada até ele aceitar