Ler pdb em java

Oi!!!
Estou precisando ler arquivos .pdb em java e não estou encontrando uma forma de fazer isso! Quem souber, por favor me ajude!!!

Obrigada!

O PDB que você fala é o Protein Data Bank ou Palm Database?

Protein Data Bank
É um formato gerado por um programa chamado Pymol, que trabalha com estruturas de proteínas.

Vê se isso serve…

Chemistry Development Kit: http://cdk.sourceforge.net/

Ele lê arquivos PDB… http://cdk.sourceforge.net/api/org/openscience/cdk/io/PDBReader.html

Estou baixando o bioeclipse e vou testá-lo daqui a pouco.

Obrigada!!!