Lidando com timeout - socket

Boa tarde galera, estou desenvolvendo uma aplicação ciente/servidor em que o cliente manda comandos pro servidor fazer, mas estou com problema em lidar com a perda de conexão. Pensei em fazer setSoTimeout(500);, mas daí eu entro em um dilema: O servidor sempre aguardará comandos do cliente (não são constantes), e se fizer o Timeout fará com que o cliente perca a conexão depois de x segundos. Gostaria de saber coomo fazer um timeout inteligente (que só desconecte-se caso realmente não consiga conectar-se ao server), mas de forma em que o servidor fique aguardando os comandos, e não leve a mensagem que será enviada para evitar o timeout como um comando válido