Bem, não consigo te dar a resposta de mão-beijada por que não uso NetBeans. Mas posso te dar um norte para suas pesquisas.
Você usa o Maven por linha de comando? Se sim, é so digitar mvn clean e depois baixar as dependências e buildar. Se você não usa pela linha de comando, vai ter que procurar no Netbeans a opção de clean do Maven.
O clean nada mais é do que a limpeza de JARs antigos, caches e qualquer coisa que pode estar relacionado ao build. É como limpar tudo para fazer o build pela primeira vez.
vlw vou dar uma procurada eu também não uso, mas tive que migrar para o netbeans não consegui de jeito nenhum rodar o fx11 no eclipse, já no netbeans foi tranquilo de primeira
Eu sinceramente não sei de onde tiraram que a versão Community é bem limitada. Algum hater falou isso e perpetuou, não é possível.
Seja diferente da massa. Experimente, e conclua você mesmo.
Absolutamente tudo que eu fiz com o Eclipse eu fiz com a Community version - e ainda fiz mais. Se você quer programar Java, IntelliJ Community tá de ótimo tamanho. O autocomplete dele é simplesmente superior, e se o seu foco é aprender isso te ajuda muito (além de obviamente aumentar sua produtividade).
Comecei com a Community e hoje tenho minha licença da Professional. Não me arrependo nem por um segundo.
Provavelmente você não usa JBoss ou Wildfly…
O plugin do JBoss para IntelliJ não funciona na versão community (não é uma experiência única, mais pessoas tiveram o mesmo problema).