Mvc e conexão java/mysql com eclipse

Tudo bem amigos? Tenho duas dúvidas, uma delas é referente a melhor organização de um projeto mvc no eclipse e a outra é quanto a configuração de um botão para inserir dados em um banco mysql. Pois bem, meu projeto está organizado da seguinte forma:
http://pastebin.com/m50d77d51
Em que diretório posso salvar o arquivo mysql-connector-java-5.04-bin?
Criei o banco através do phpMyAdmin devo exportá-lo para o diretório controller?
Aqui está o código da classe Janela Cadastro: http://pastebin.com/m337db793
Como posso configurar o botão Inserir, para fornecer os dados para o mysql?