Netbeans / tres camadas

Sou iniciante em java, estou com certas dúvidas com relação a maneira de desenvolver com os padrões convencionais, tive sabado minha primeira aula no curso sobre mvc usando o netbenas, porem sem o uso de frameworks, gostaria de saber se alguém tem alguma aplicação pra me passar como exemplo, pois eu nunca vi uma estrutura, um projeto desenvolvido parcialmente, nada, somente exemplos muito simples que nao consigo visualizar uma maneira mais profissional de programar, gostaria que alguém pudesse me ajudar pois quero muito começar a programar o meu projeto final porém se o padrão não for seguido não irei aprender o que devo pra entrar no mercado Java…