Onde trabalho usamos o Oracle como banco de dados principal, onde se concentra as informações do nosso ERP atual. Nosso ERP anterior utilizava SQL Server que nunca deixou a desejar, trocamos de ERP por motivos que nada tem haver com os SGBD’s.
Em nossa experiência percebemos que o Oracle possibilita várias ferramentas e possibilidades para trabalhar com Disaster e Recovery, o SQL Server não tem tantas ferramentas para isso mas não significa que as que têm sejam ruins.
Atualmente estamos começando a desenvolver nosso Data Warehouse e optamos pelo SQL Server por conta do Integration Services e outras ferramentas (por sinal excelentes ferramentas) que auxiliam a criação de BI.
Em relação a desempenho como o colega falou, acredito que um bom trabalho do DBA com coisas simples como índices, chaves e tudo mais você terá excelentes resultados em qualquer um dos SGBD’s.
Acredito que não tenha respondido a sua pergunta, apenas acho que são duas excelentes ferramentas e qualquer uma delas tem prós e contras, e como nas linguagens de programação existem os que travam batalhas dizendo que uma é superior a outra e tal. Não existe uma melhor em tudo que a outra, existe aquela que é a ideal para o cenário proposto.
Boa sorte e depois nos diga o desfecho da história.