O diretorio chamado ROOT nao em significado especial em aplicacoes Web. Deve ter sido criada por algum plugin ou servlet-container para guardar determinadas informacoes nao pertinentes ao desenvolvimento.
Os JSP’s/html/imagens voce pode deixaar na pasta raiz da tua aplicacao web ( e isso vai depender de onde voce instalrou ela, mas pode ser algo como /usr/local/tomcat/webapps/MeuPrograma, por exemplo ).
Se a pasta ROOT que voce esta falando eh uma que tem algum diretorio do Tomcat ( ou outro servlet-container ), entao voce esta jogando os arquivos no lugar errado ( ja que esta pasta da para ser considerada do sistema, e nao deveria ser usada para colocar as aplicacoes normais ).
Rafael
danieldestro
A pasta ROOT, pelo menos no Tomcat, é a pasta da aplicação root (principal)