Por que não existe o método notEquals()?

Não.
Seriam mais linhas de código desnecessárias.
Em tempo, as tags do Struts 1 possuem notEquals.

Seria uma boa já que o operador ! do Java e C são uma merda pra intender e percebê-lo.

Mas como nosso amigo disse, linhas jogadas fora.

Bom, o nome bonitinho para esse método não seria “notEquals” mas sim “isDifferentFrom”.

É mais porque ficaram com preguiça mesmo