Olha, acho que não há hoje no mercado nenhum CMS (ou similar) que supere o Joomla, principalmente quando o assunto é aceitação, suporte, comunidade, entre outros fatores.
Alguns sites governamentais que utilizam Joomla:
http://portal.mec.gov.br
http://www.cnj.jus.br
Há outros sites de órgãos abaixo da presidência utilizando o CMS, além do MEC, citado. Existem também muitos portais estaduais e de prefeituras. Não é difícil encontrar se fizer uma rápida procura.
Com o Joomla! você pode criar de tudo, há uma página com extensões (comerciais e não-comerciais):
http://extensions.joomla.org/
Há também inúmeros sites que desenvolvem e distribuem ou vendem templates profissionais para Joomla.
Depois do Joomla, na minha opinião, vem o WordPress. Mas este é feito para Blog, apesar de haver cada vez mais sites desenvolvidos através dele.
A área administrativa do WordPress é bem mais simplificada que a do Joomla. Mas como dito: teoricamente o WordPress é um Blog e o Joomla um CMS (ou Portal?), então as opções de controle sobre a aplicação são bem mais abrangentes. Um exemplo de site governamental utilizando WP:
http://blog.planalto.gov.br/
Bom, este assunto já está ficando OFF Topic, pois estamos no GUJ! Hehehe…
rlanhellas , no seu caso eu acho boa a escolha: Joomla + WP.
Você cria o portal e suas funcionalidade em Joomla.
Para o blog de cada diretor você faz chamadas externas para blogs em WP.
E caso precise desenvolver alguma aplicação faça também chamadas externas, para sua(s) aplicação(ões).
O CNJ faz isso: trabalha com Joomla e Java.
Dê uma olhada!