Primeiro Projeto Java Web- Problemas com o Servidor Tomcat

Olá pessoal, gostaria de ajuda em relação aos projetos, pois não entendi muito bem como funciona a arquitetura de uma aplicação, e nem como ela é anexada ao servidor tomcat
por exemplo; eu criei alguns projetos no netbeans, a IDE ja faz toda a configuração do projeto para mim. O que eu quero é criar um projeto
sem o netbeans, para ver como ele está organizado.

Tentei criar um projeto dentro da pasta webapp do tomcat (obs: eu uso o gerenciador Xampp) porém quando acesso o localhost:8080 a pasta não está lá
e não consigo testar a aplicação

se alguem puder me ajudar como que eu monto um projeto sem o netbeans, onde eu o crio, como as pastas se organizam e como eu
importo ele para dentro do tomcat.

Grato!!!