Cara,
Tenta abrir o seu relatório como WordPad e vê este alinhamento no código-fonte dele, já aconteceu comigo de eu colocar um recurso no iReport em um campo e ele não aparecer; daí eu o abri no WordPad e quando fui ver o recurso não estava no código-fonte; daí eu o coloquei na mão, salvei o arquivo, entrei no iReport, compilei o relatório e o recurso apareceu !