Problema com o Git quando modifico Libs do projeto

Então galera, to com um problema… to começando a usar o git, e ele funciona superbem, até eu fazer modificações de libs no projeto… tipo, eu modifico as libs, direitinho, tudo funcionando, mas quando outro desenvolvedor puxa o projeto, e tenta dar merge com o dele, da erro. Diz que não pode dar merge por uma série de motivos, mas o que normalmente aparece é que ele da conflito com as libs antigas… ja tentei várias coisas, inclusive mudar as libs do projeto do outro desenvolvedor na mão, mas continua dando erro… alguém saberia o que pode ser isso??