Problema em aplicação rodando em windows

Ae galera
Eu desenvolvi uma aplicação no linux ubuntu
Ae eu distribui ela no windows
Tem alguns caracteres que ficou zuado, tipo uns simbolos meio doido
Deve ser por causa do padrão do linux q eh UTF-8 e so windows q eh ISO-9

Existe alguma linha de comando que eu digito na aplicação pra converte tudo pra UTF-8 em python tem uma linha q digita no inicio do codigo que converte tudo pra UTF-8 !~~ coding UTF-8 ~~

Em java eu nao sei

Alguem ae pode me dizer se tem uma linha de comando tipo essa?

Atenciosamente