Estou com o mesmo problema, já mudei o timeout e ainda nada de funcionar, já deixei em 500s e nada ainda.
Utilizo o EclipseEE Version: 3.7.1. e JBOSS Version 5.1.0.GA.
Porém quando eu starto ele manualmente usando o run ele roda tranquilamente e starta em 2min ±.(Sim, essa é uma maquina porcaria) 
Alguma ideia do que pode ser?