Problema para abrir PDF no IE usando o itext

Tenho um servidor tomcat5.5 + java6 instalado em um servidor linux, o webserver utilizado é um apache 2 que faz proxypass das requisições ao tomcat. Neste tenho um sistema escolar em java que gera alguns relatórios em PDF, este relatórios são gerados normalmente no Firefox, Chrome e Opera, mas no IE não é gerado. O comportamento quando mando gerar o relatório é abrir uma nava página/aba com a linha da requisição que gera o PDF, e este PDF é aberto no Acrobat Reader. Mas isso não ocorre no IE, fora este sistema o IE abre PDF normalmente. No processo java no servidor linux vejo que é gerado o PDF pela thread java. No sistema é usado o itext para gerar o PDF.
Alguém já passou por isso que possa ajudar a resolver este problema?