Problemas de timeout com eclpse + maven + websphere

Olá, estou com alguns dias com um problema um tanto estranho em um sistema legado de quase 20 anos.

Nossas builds eram todas com ANT mas modificamos para utilizar Maven.
Os projetos estão redondinhos, tudo compila no Maven que é uma maravilha, os EARs são gerados corretamente e quando instalamos no WebSphere funciona.

O problema está em fazer a manutenção destes projetos no eclipse rodando o WebSphere localmente. O EAR é adicionado sem problema nenhum no server runtime, o problema é que quando se navega pelo sistema, acontecem timeouts do nada. Fez login no sistema, clicou em algum link, pronto: Session timeout!

Como se em runtime alguma configuração estivesse sobrescrevendo as configurações de timeout do websphere. Nosso web.xml está com o session-config setando um session-timeout de 60 minutos, mas não surte efeito.

Alguém sabe de algum arquivo de configuração ou log do WebSphere o qual eu possa encontrar pistas do que está havendo?
Ou será que falta alguma configuração nos pom.xml do Maven?

Utilizamos Java EE 5, Java SE 6, WebSphere 8 e eclipse neon.
Por questões contratuais, não é possível uma evolução tecnológica no momento, por isso vai continuar com essa configuração.
Então de nada adianta sugerir para usar Java, eclipse e WebSpheres mais recentes.

Qualquer dica será bem vinda.

Tem algum log que ajude ?
Pode ser algum efeito do horário de verão?
Debug remoto consegue interceptar o filtro de sessão?

Já olhei todos os arquivos de log do websphere e do eclipse, não encontrei nada suspeito.

Não, já estamos há mais de 2 meses tentando resolver o problema.

Boa, não tentei depurar os filters. Vou dar uma olhada.