Pelo que entendi você quer comparar duas listas e identificar a posição de dois elementos iguais em cada lista.
Se for isso, tente dessea forma:
for(int pos = 0;pos < lista1.size();pos++)
{
for (int i = 0; i < lista1.size(); i++)
{
if (lista1.get(pos) == lista2.get(i))
{
dif = i - pos;
if (dif == 0)
{
System.out.println("Os elementos estão na mesma posição ");
}
if (dif != 0)
{
System.out.println("O elemento esta na "+pos+
"ª na lista1 e na "+i+"ª posição na lista2. A diferença é:"+dif);
}
}
}