Querys afectam systema

Ola a todos, Estou a efectuar consultas a uma base de dados (SQL Server ) atraves de uma class java. o meu programa efectua uma consulta de 40 em 40 segundos,
pois preciso de verificar se determinado cliente fez algum registo, para a seguir poder notifica-lo. Haverá algum problema a nível de sistema ( Iseries ) em
realizar consultar regularmente? qual o maximo de consultar poderei fazer sem prejudicar o sistema ? nas minhas consultar eu abro a ligação consulto e em seguida fecho.
Haverá algum problema ? Os administradores de sistemas queixam-se que há muitos logs com o meu utilizador. Haverá razões para eu me preocupar ? Obrigado