Qual mensagem está aparecendo exatamente?
Dependendo da mensagem isso é configuração do Browser.
O que acontece é que existem itens da sua página que não estão sob o HTTPS exemplo imagens.
Pode haver alguma imagem que está sendo chamada de uma url ou uma página não segura.
Consegui configurar meu tomcat para fucnionar com HTTPS, porém a cada nova requisição feita pela aplicação web, é exibido o alerta sobre acesso à uma área segura pelo browser. Como faço para exibir essa mensagem apenas na primeira requisição. Imagino que isto é o normal.
A mensagem está em anexo