Rodando arquivo script via jdbc

galera , to precisando rodar um script de geração de banco por dentro da minha aplicação. Existe alguma forma de fazer isso ? vc s tem alguma ideia ?
o mysql possui um comando chamado source script.sql e então o script é gerado .
Ja tentei ler o arquivo e ir executando os comandos lidos … porem isso mostrou-se inviavel devido ao tamanho dos inserts …
valeu pela força galera