Source not found Erro - Tomcat / Mysql

Pessoal estava debugando um exemplo com acesso ao banco Mysql, e após uma chamada ao ContextListener a execução tenta chamar uma sequencia de métodos, mas eles não estão sendo reconhecidos. Tais como

Source not found for StandardContext.listenerStart() line: 3827

Vc sabem o que pode ser?

Acho que encontrei a solução…
Essa classe (StandardContext) está no .jar $CATALINA_HOME/server/lib/catalina.jar …

Parece que á a classe padrão que faz controle de listeners para o tomcat.

Mas eu pensava que o plugin do tomcat já inseria no projeto os pacotes básicos. Ou então pelo menos apontava pro diretório. Eu vo ter que ficar inserindo sempre no projeto os pacotes toda vez que acontecer isso?