Sugestão para a construção de db usando hibernate

Ola rapaziada
Tenho um banco de dados legado e vou fazer um app usando a mesma estrutura utilizando hibernate. to liberado para modificar o banco. Mas gostaria de saber quais as melhores praticas para fazer algo bem feito.
Existe alguma tabelas não possui auto increment,nesta situação é melhor adicionar? São duvidas de iniciante. Mas gostaria de algumas opiniões, dicas e sugestões referente a construção do db.
Obrigado e t+
ps: já li o artigo que esta no site e uns artigos pela net