Tomcat 5.5 / webapps

Sou novato utilizando ambiente web com java. O problema e que tenho um servidor rodando aqui com tomcat+mysql+phpmyadmin e quero aprender um pouco sobre o tomcat, existe uma pasta chamada webapps dentro do tomcat, sei que ali fica alguma coisa do programa que acesso pela web, mais se no caso eu quiser editar alguma coisa deste programa que roda no tomcat eu tenho que mexer nos arquivos dentro da webapps/? alguem poderia me ajudar na funcao das pastas que ficam dentro desta pasta? O que eu precisaria editar ali dentro fora as pastas do programa.
Pessoal estou querendo aprender sobre isso, se alguem puder me dar uma luz.