Verificar se tem algum elemento repetido na matriz

Programação Java
#1

Pessoal não estou conseguindo fazer contar certo se tem elementos iguais na matriz.

Digamos que ele conta certinho mas quando não tem elementos repetidos ele conta igual

public class {
public static void main (String args[]){
int[][] mat = new int [2][2];
int lin=0; int col=0; int cont=0; int soma=0;

System.out.println ("---MATRIZ---");
for(lin=0; lin< mat.length; lin++){
  for(col=0; col<mat[0].length; col++){
    mat[lin][col] = (int) ((Math.random()*99)+1);
    System.out.print (mat[lin][col]+"\t");
  }
  System.out.println();
}
for(lin=0; lin< mat.length; lin++){
  for(col=0; col<mat[0].length; col++){
    for(int l=0; lin< mat.length; lin++){
      for(int c=0; col<mat[0].length; col++){
        if (l==lin){
          cont++;
        }
        if (c==col){
          cont++;
        }
      }
    }
    if(cont>1){
      System.out.println("Existe(m) "+cont+" numero(s) repetido(s).");
    }else{
      System.out.println("Não existe nenhum elemento repetido");
    }
  }
}

}
}