Aprender AngularJS com JavaWEB

estou aprendendo Java Web, seria bom aprender AngularJS também ou ficaria um pouco complicado porque mistura um pouco o conhecimento?

Seria bom e seria complicado.
Pense que você está fazendo um curso de francês e deseja aprender italiano, ao mesmo tempo. Tem muitos conceitos parecidos, mas a essência é diferente.
Foque no java web, entenda os conceitos e o funcionamento, depois, parta para angularjs.

tbm achei, se JavaWeb sempre me enrolo rsrs e isso demanda tempo para tentar dominar.

É inevitável que tenhamos ansiedade enquanto começamos a desenvolver, ainda mais para a web.
Acontece que, efetivamente, precisamos de uma certa disciplina, para que não coloquemos os carros na frente dos bois e façamos com que tudo se perca.
Java web é um emaranhado gigante de opções. Eu sugeriria que você seguisse seus estudos até estar tranquilo com web services e restful. A partir daí, você deve partir para o angular js ou react js ou jquery…