Cliente para Web Service trazendo classe errada ou duplicando

Estou fazendo meu primeiro projeto utilizando Web Services,estou utilizando o NetBeans + Tomcat(também já utilizei o Glassfish). Fiz o teste do WS no servidor e estão funcionando. Porém, quando vou criar o Cliente para Web Service, na aplicação Cliente, seleciono o WSDL e no momento de fazer a importação algumas classes vem incorretas.
Por exemplo: No Servidor tenho as classes Cliente e Funcionário. Quando importo o Cliente pelo WSDL, todos os métodos são de Cliente, porém a vem a classe Funcionário ao invés da Classe Cliente.