JPA+HIBERNATE+JDBC na mesma aplicação

olá a todos, estou usando JPA+HIBERNATE+JDBC na mesma aplicação, pela intimidade com uma, e a facilidade com a persistência de dados da outra, enfim…foi a maneira a qual achei para facilitar minha vida, porém quando estou rodando a aplicação de dentro da IDE, NetBeans no caso, a aplicação funciona 100% gera todos os relatorio que quero (Ireport), mas quando eu compilo a aplicação, não funciona mais, os relatórios que dependem do JDBC nao abrem, ja verifiquei todas as “classesDAO” para verificar se existiam metodos que nao fecharam as conexões e todos estao certos., acredito ser algo relacionado ao banco de dados, mas talvez alguem ja tenha passado por situação igual…se alguem tiver alguma ideia !..usando mysql 8 , obrigado!