Modelagem da iteração ou do projeto completo?

Vocês que desenvolvem dividindo o projeto em iterações, vocês fazem o projeto e modelagem de todo o software ou apenas dos elementos da iteração?

Não existe modelagem em iteração. Isso criaria pequenos pedaços de um grande Frankenstein.
Você faz um modelo do todo, mesmo que grosseiro, aí vai dividindo e detalhando.

De que projeto e modelagem está falando? Sobre quais tipos de decisao está se referindo?

Complementando.
Você sempre precisa olhar o todo, antes de olhar os detalhes. E se você tem 4 módulos que consomem um único WS e cada módulo quer alterar aquele WS de maneira específica? Como você vai garantir a integridade dos outros 3, sendo que 1 está sempre mexendo naquilo. Ou, como garantir que não haverá conflitos, sendo que todos mexem no mesmo ponto do sistema?