MongoDB vs Lucene?

Olá galera!
Hoje eu comecei a estudar o Lucene, pois minha aplicação esta feita em MongoDB e o mondo não oferece muitas ferramentas para buscas(ainda). No entanto quando fui pesquisar integração de Lucene com o nosql, encontrei alguns posts no Stackoverflow comparando MondoDB vs Lucene, aí eu fiquei com certas duvidas, pois o mongodb é um banco de dados orientados a documento e o Lucene um indexador em documentos. Eles não deveriam serem comparados entre si, certo?
Mas pelo que entendi parece que o Lucene (talvez junto com o Solr), também é usado para armazenar dados, ou não? Não é viável!
Resumindo, posso ficar tranquilo ao trabalhar com mongo como banco e Lucene como indexador para minhas buscas?
O banco não é problema, minha duvida é só o lucene junto com ele.