Porque uma JFrame criada no eclipse é diferente de uma criada no netbeans

O Netbeans deve ajustar automaticamente o lookandfeel do JFrame, mudando a decoração (e portanto o visual).

No Eclipse, se você está criando um JFrame via código (ao invés de visualmente, como no Netbeans), precisa configurar o lookandfeel do JFrame. Geralmente, isso é feito no construtor. Algo como:

try {   
  UIManager.setLookAndFeel(UIManager.getSystemLookAndFeelClassName());  
} catch (Exception ex) {  
  ex.printStackTrace();  
}

Abraço.

Complementando, o netbeans gera templates xml (metadados) sobre a aplicação, posicionamento de elementos etc (e gera até muitas dores de cabeça por causa disso), já o eclipse é “seco” não existe auxiliar

Sugiro um plugin no eclipse, a muito tempo mexi com WindowBuilder Pro, bem leve, não invasivo como netbeans e ainda possui arrasta e solta