Utilizando o Javascript no Indesign

Estou tentando utilizar o Javascript pra auxiliar na formatação de eBooks. No Indesign, quando se exporta para o formato ePub é possível marcar uma opção de utilizar um arquivo .js externo, bem como .css. Pro CSS funciona perfeitamente, mas quando exporto com um arquivo .js, simplesmente não acontece nada, é como se não houvesse arquivo nenhum. Alguém saberia dizer a maneira correta de realizar essa operação ?