Validar e Autenticar Certificado no Servidor

Já procurei incansavelmente pela web, inclusive aqui mesmo neste fórum, e não obtive uma informação precisa de como validar um certificado enviado via web service de um cliente na aplicação server. Como seria esta rotina para autenticar o referido certificado. Utilizo o servidor GlassFish.
Agradeceria imensamente se alguém pudesse ajudar.